Les Aeons appartiennent à l’une des quatre grandes factions : l’Olympe, demeure du panthéon grec ; Thèbes, le royaume de l’Égypte mythique ; l’Océan, où vivent les légendes des mers ; et les Enfers, où règnent les mythes les plus sombres. Au-delà de la faction, chaque Aeon se range du côté de l’Ordre ou du Chaos, un détail qui compte pour certains effets d’équipe et certains choix narratifs.
Les rôles de combat suivent quatre classes classiques. Les Tanks tiennent la ligne de front et encaissent les dégâts ; les Guerrières infligent de lourds dégâts monocible ou de zone ; les Ranger frappent à distance et exploitent les points faibles ; les Supports soignent, protègent et renforcent le reste de l’équipe. Une composition équilibrée mélange en général les quatre : les équipes purement offensives nettoient vite les premiers étages mais calent devant les boss de longue haleine.
La rareté va de SSS, tout en haut, jusqu’à F. Les Aeons de haute rareté démarrent avec de meilleures statistiques de base et des compétences supplémentaires, mais les personnages de rareté faible ne sont pas inutiles : liens, éveil et équipement peuvent porter une favorite jusqu’au contenu de fin de jeu, et plusieurs personnages gratuits de l’histoire sont de véritables choix forts.